O anime conta a historia de Uzumaki Naruto (agora mais velho), em sua busca para salvar seu amigo Sasuke de Orochimaru.
A trilha sonora da série foi produzida por Toshiro Masuda.
Nota: Naruto Shippuden é um anime lançado semanalmente no Japão, e atualmente sem prévia de seu término. O tempo entre o lançamento de um capítulo para o outro é de normalmente de 7 a 10 dias...
1ª Temporada
01/02 - Especial de nova fase!
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03 - Resultado do Treinamento!
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04 - O Jinchuuriki da Areia
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05 - Como Kazekage...!
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06/07 - Arte é um estouro! Especial Naruto Shippuuden
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08/09 - Time Kakashi se prepara! Naruto Shippuuden Especial.
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10 - Técnica de Selamento - Os Nove Selos do Dragão Fantasma!
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11 - A Pupíla da Ninja de Cura
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12 - A Decisão da Velha Ninja
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13 - Encontros Predestinados
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14 - O Crescimento de Naruto
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15 - O Nome da Esfera Oculto...!
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16 - O segredo por trás de um Jinchuuriki
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17 - A Morte de Gaara!
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18 - Invasão! A investida Gancho-Lateral.
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19 - A armadilha! Os inimigos da equipe Gai
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20 - Hiruku vs As Duas Ninjas
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21 - O Rosto de Sasori
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22/23 - Especial Naruto Shippuuden: Batalha de Verão!
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24 - O Terceiro Kazekage
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25 - Três Minutos Entre a Vida e a Morte
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26 - 10 marionetes vs 100 marionetes
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27 - ...
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28 - As Feras Ressuscitadas
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29/30 - Mande-o Para a Próxima Dimensão!
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2ª Temporada
31 - A Próxima Geração
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32 - O Retorno do Kazekage
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33 - O Próximo Alvo
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34 - Formação, Novo Time Kakashi!
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35 - Adição Malquista
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36/37 - Um Sorriso Falso
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38 - Simulação
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39 - Ponte do Céu e da Terra
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40/41 - A Hora da Luta Chegou!
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42 - Orochimaru vs. Jinchuuriki
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43 - As Lágrimas de Sakura
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44 - As Lágrimas de Sakura
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45 - Um Final Traiçoeiro
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46 - A Página Inacabada
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47 - Infiltração! O Venenoso Covil da Cobra
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48 - Laços
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49 - Uma Pessoa Importante!
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50 - O Livro de Desenhos Conta uma História
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51/52 - Reunião / O Poder do Uchiha
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53 - As Folhas Germinam...
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3ª Temporada
54 - Pesadelo
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55- Vento
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56 - Contorção
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57/58 - Garras Encapuzadas que Rasgam a Escuridão! O Vento Forte que Atravessa
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59 - Novo Inimigo
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60 - Roda da Fortuna
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64/65 - Vigília Cerrada
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66 - Almas Revividas
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Naruto Shippuuden é uma série de anime, sequência do popular Naruto, e corresponde a segunda parte do mangá de mesmo nome. A série começou a ser exibida no dia 15 de Fevereiro de 2007 na TV Tokyo após cinco anos de exibição da primeira série (sendo dois anos apenas de fillers - sagas que não seguem as histórias do mangá de origem).